I corsi d'acqua umbri sono stati sottoposti ad una graduale diminuzione di "naturalità", imputabile prevalentemente all'incremento della pressione antropica ed alle alterazioni morfologiche. Questo contesto di degrado ambientale ha interessato prevalentemente alcuni fiumi che attraversano il territorio umbro, tra i quali il Nestore, uno dei principali tributari di destra del F. Tevere, cui è stato assegnato lo stato di qualità ambientale "scadente" in base alla classificazione prevista nel  D.L. 152/99. Tale situazione ha fatto emergere la necessità di uno studio che potesse definire lo stato di qualità ambientale del fiume Nestore e dei suoi principali affluenti ed evidenziare le principali criticità esistenti. Lo studio è stato effettuato in un arco temporale di due anni, con indagini in campo ripetute in due periodi distinti, riconducibili ai periodi di magra e invernale dei corsi d'acqua, per verificare lo stato ambientale in condizioni idrologiche opposte. Le campagne di monitoraggio sugli affluenti Genna e Caina sono state effettuate in un solo periodo di riferimento, quello estivo.